Esiopetus
Esikoulu kestää kaksi vuotta. Oppilaat valitaan esikoulun 1. luokalle esikoulunopettajan arvioinnin perusteella. Arvioinnissa kiinnitetään huomiota lapsen kehitystasoon ja saksan kielen taitoon, aikomukseen pyrkiä Saksalaisen koulun 1. luokalle sekä hänen yhteyksiinsä saksankielisiin maihin (esim. perheen kaksikielisyys, sukulaissuhteet tai oleskelu saksankielisessä maassa). Esikoulun 1. luokan oppilaiden pitää täyttää koulunaloitusvuonna vähintään 5 vuotta.
Perusopetus 
Saksalaisen linjan (a-luokat) 1. luokan oppilaat valitaan helmikuussa järjestettävän soveltuvuuskokeen perusteella. Arvioinnissa kiinnitetään erityisesti huomiota oppilaan saksan kielen taitoon.
Suomalais - saksalaisen linjan 1. luokalle valitaan oppilaat helmikuussa järjestettävän soveltuvuuskokeen perusteella. Linjalle hakeutuvien ei tarvitse osata saksaa.
Kaikkien peruskoulun 1. luokan oppilaiden pitää täyttää koulunaloitusvuonna vähintään 7 vuotta. Poikkeustapauksissa voidaan oppilaaksi ottaa nuorempikin lapsi. Viimeksi mainitussa tapauksessa vanhempien tulee esittää perusopetuslain 27 §:n mukaiset selvitykset. Rehtori voi joka tapauksessa asettaa vanhemmat hakijat etusijalle oppilaspaikkoja täytettäessä.
Lukio
Oppilaat, jotka ovat saaneet peruskoulun päättötodistuksen Helsingin Saksalaisesta koulusta ja ovat suorittaneet kielidiplomi I -tutkinnon, voivat jatkaa opintojaan suoraan oman koulun lukiossa.
Suomalaisen peruskoulun käynyt oppilas voidaan ottaa Saksalaisen koulun lukion ensimmäiselle luokalle, jos hän on suorittanut kielidiplomi I -tutkinnon tai siihen verrattavissa olevan saksan kielen kokeen. Oppilaaksi ottamiseen vaikuttaa peruskoulun päättötodistus.